NgAgo第二篇原创论文出炉, 基因编辑证实还是证伪?

11月11日，由中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所和中国细胞生物学学会共同主办、Nature Publishing Group出版的Cell Research在线发表一篇来自南通大学刘东课题组和复旦大学王永明教授的论文，题为：

NgAgo-based fabp11a gene knockdown causes eye developmental defects in zebrafish

论文以Letter to Editor形式呈现, 立刻引起广泛关注。

今年5月，河北科技大学韩春雨课题组与浙江大学沈啸教授在 Nature Biotechnology 发表题为：

DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute

的论文，报道了NgAgo基因编辑技术，引起轰动。然而，其结果的可重复性很快受到质疑，并逐渐演变为在国内外影响广泛的学术争议事件。韩春雨因为这一论文，在获得不少荣誉的同时，也受到了巨大的舆论压力。根据Google Scholar检索，该论文发表后，已经被引用近40次，但多为评论或综述性文章引用，截止昨天，还没有基于NgAgo的原创性论文发表。此前针对这一工作的质疑，也局限于大众媒体和科学新闻，尚未有严肃的学术论文出现。Cell Research昨天在线发表的这篇NgAgo文章，是韩春雨NBT论文后的第一篇，因此受到高度的重视。

Cell Research 2015年影响因子14.812，超过了Nature子刊Nature Structural & Molecular Biology, 在细胞生物学187家期刊中排名第九，是中国本土期刊中的佼佼者，也为中国相关领域学者提供了强有力的话语权。知社此前曾作专题报道：中国期刊的影响因子神话: 从2.16到12.41!

有读者可能会质疑，Letter to Editor不应该算做论文。但是，根据Nature网站，在Cell Research，

Letters to the editor report novel findings that have an immediate major impact on current biological research with only one figure and less than 10 references.

而根据Cell Research网站，

Letters to the Editor provide rapid and concise report of a novel finding that is brief in nature but is of general interest to the field.

因此，对Cell Research而言，Letter to Editor作为原创论文应该没有疑议，而且所报道的是具有重大影响的原创发现。在这篇文章中，作者开门见山，第一句话就指出其工作受韩春雨论文启发：

A recent report of genome editing using Natronobacterium gregoryi Argonaute (NgAgo) with guide DNA (gDNA) in human cells prompted us to explore the utility of this protein for in vivo genetic manipulation in zebrafish (Danio rerio).

第一段最后则点明其研究目的：

Here we investigated whether the gDNA/NgAgo system could be used to manipulate zebrafish genes in vivo using fabp11aas a test case.

因此，其结论尤其受到关注。不过，作者行文相当谨慎，使用的是manipulate一词。那么，这篇论文报道了什么样的发现呢？ 因为Letter to Editor没有摘要，我们直接看最后的总结：

In summary, our study shows that gene knock down is the main mechanism by which gDNA/NgAgo affects gene function in zebrafish... In addition, we have failed to detect any mutation in all the embryos we examined... we hypothesize that gDNA/NgAgo may bind to a target gene to block its transcription. Overall, we suggest that the gDNA/NgAgo system provides an alternative strategy for gene knockdown in zebrafish.

简言之，没有发现NgAgo基因编辑，但可以基因敲低，下调目标mRNA的表达水平。大伙可以在文末下载两篇论文进行比较。

论文通讯作者刘东博士在接受BioArt采访的时候含蓄地表示：这个研究是意外的一个小发现，并没有支持或者反驳韩教授的结果。而共同作者王永明教授则称，这个工作对于斑马鱼基因敲低十分有意义。

科学总是波浪式前进。可以预期，随着时间的推移，基于NgAgo的基因调控论文会更多的出现。当大众的喧嚣逐渐回归科学的讨论，NgAgo是否具备基因编辑功能也会越来越清晰。

公众号下回复Ago，可以下载两篇论文进行比较。

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